Se sabe que la ciudad del Cusco estaba ya habitada hace más de 3000 años por migrantes originarios, probablemente de Tiahuanaco, que eran pequeños grupos humanos migrantes. Posteriormente, alrededor del año 1000 d.C., culturas y etnias regionales como los Antasayac, Killque, entre otros, y culturas complejas como la Wari ocuparon la zona que hoy en día ya es conocida como la ciudad.